Няма лечение за въглен гниене на тиквички. Фунгициди (семена лечение и листни) се оказаха неефективни в управлението това болест. Препоръчва се да се върти към култура, която не е гостоприемник за 3 години; обаче практичността и ефикасността на това е съмнително по няколко причини.